EL GENOMA DE LOS ARGENTINOS
Hacia un modelo genómico-estadístico de nuestras poblaciones
Financiación: PICT-2014-1597. FONCYT-ANPCYT. PIP 0208/14. CONICET
Las enfermedades humanas más comunes son de carácter poligénico y multifactorial. Los proyectos de diversidad genética mundial han contribuido a avanzar en la localización de los factores genéticos responsables de muchas de ellas a través de estudios de asociación de genoma completo (GWAS). A pesar del enorme adelanto en esta área, hay dos factores que impiden la aplicación de los adelantos de la medicina de precisión a amplias regiones del mundo: 1- la ausencia de conocimiento de la diversidad y estructuración genética de las poblaciones humanas de regiones no muestreadas por los consorcios internacionales y 2- el sesgo de representación de genomas europeos en las bases de datos de asociación a enfermedades.
En esta línea de investigación nos proponemos avanzar con el estudio de la variación genómica de nuestras poblaciones, principalmente mestizas utilizando metodologías genómicas, modelos demográficos y recursos bioinformáticos que definan un modelo estadístico de referencia de la diversidad genómica humana en nuestro país. La construcción de un modelo genómico de referencia de los argentinos es de fundamental importancia para la realización de comparaciones en cualquier estudio de asociación de genoma completo, representando por esto un recurso invalorable para todos los grupos que quieran hacer genómica médica con muestras argentinas.
En esta línea de investigación nos proponemos avanzar con el estudio de la variación genómica de nuestras poblaciones, principalmente mestizas utilizando metodologías genómicas, modelos demográficos y recursos bioinformáticos que definan un modelo estadístico de referencia de la diversidad genómica humana en nuestro país. La construcción de un modelo genómico de referencia de los argentinos es de fundamental importancia para la realización de comparaciones en cualquier estudio de asociación de genoma completo, representando por esto un recurso invalorable para todos los grupos que quieran hacer genómica médica con muestras argentinas.
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pleiotropía antagonista y Selección EMBRIONARIA
RIESGO POLIGÉNICO y fenotipos anticorrelacionados
La predisposición genética que cualquier individuo tiene a desarrollar una enfermedad compleja puede calcularse a través del puntaje de riesgo poligénico (PRS). El PRS se calcula sumando la contribución genética de cada uno de los loci asociados a la enfermedad (dosage genético), y ponderándolos por el valor de su asociación efectiva con dicha enfermedad. Actualmente existe un debate sobre la utilidad de los PRS en la clínica, ya sea como predictores del riesgo individual, o como herramientas para estratificar la población, e implementar políticas diferenciales de salud. Sin embargo, el PRS se utiliza en algunas clínicas de fertilización asistida para priorizar la transferencia de embriones con bajo riesgo genético en el desarrollo de enfermedades comunes (cáncer, diabetes, esquizofrenia, etc.), o para evitar la implantación de embriones con un alto riesgo genético de desarrollar una o más de estas enfermedades.
En esta línea de investigación, analizamos la distribución conjunta de los PRS entre pares de enfermedades comunes, en diferentes poblaciones humanas para comprender si la pleiotropía generalizada del genoma puede producir resultados no deseados en este proceso de selección embrionaria.
En esta línea de investigación, analizamos la distribución conjunta de los PRS entre pares de enfermedades comunes, en diferentes poblaciones humanas para comprender si la pleiotropía generalizada del genoma puede producir resultados no deseados en este proceso de selección embrionaria.
Diversidad mitocondrial DE PACIENTES FIV
Linajes mitocondriales en EMbriones con test genético preimplantacional (PGT)
La secuenciación NGS de baja profundidad de miles de biopsias anonimizadas, derivadas de embriones de pacientes que asisten a clínicas de fertilización in vitro (FIV) para realizar PGT de aneuploidías, provee una muestra masiva y sesgada, sin una dirección a-priori definida, para el estudio de la diversidad genética de linajes maternos mitocondriales de nuestro país.
El objetivo de esta línea de investigación es analizar cualitativa y cuantitativamente la diversidad de linajes continentales intra e inter-pacientes derivados de estos casos clínicos, generar una herramienta que automatice los resultados de la secuenciación NGS del laboratorio de biocódices e informar en tiempo real las actualizaciones en un servidor web local.
El objetivo de esta línea de investigación es analizar cualitativa y cuantitativamente la diversidad de linajes continentales intra e inter-pacientes derivados de estos casos clínicos, generar una herramienta que automatice los resultados de la secuenciación NGS del laboratorio de biocódices e informar en tiempo real las actualizaciones en un servidor web local.
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